Угловой дом по набережной реки Фонтанки и Невскому проспекту был построен в 1839 году по проекту архитектора Василия Егоровича Моргана для купца И.Ф. Лопатина.
В 1872-1874 годах архитекторами Николаем Васильевичем Набоковым и Вениамином Егоровичем Стуккей корпус по Невскому проспекту был перестроен, все лицевые и дворовые корпуса объединены в один большой дом с двумя внутренними дворами, лицевые фасады оформлены в стиле эклектики.
До Великой Отечественной войны здесь располагался Исполком районного совета.
В 1941 году центральная часть корпуса по Невскому проспекту была полностью разрушена фугасной бомбой.
Работы по реконструкции здания начались ещё во время Великой Отечественной войны и были закончены в 1950 году. Проект реконструкции выполнили архитекторы Борис Николаевич Журавлёв и Игорь Иванович Фомин в приёмах советского неоклассицизма.
Дом по набережной реки Фонтанки, 40/68, лит. Б стал одним из первых зданий, восстановленных в Ленинграде в послевоенные годы.
В 2010-2012 годах выполнены работы по реконструкции здания с приспособлением для современного использования.